Кафедра обліку та аудиту була створена наказом ректора КМУЦА № 8 від 30.01.1998 р. як випускова по спеціальності 7.050106 «Облік і аудит» (ліцензія Серія ВПД-ІV №118358, видана Міністерством освіти України), яку очолив професор, доктор економічних наук Єлагін Володимир Тимофійович.
З 2000 року по липень 2004 року кафедру очолював доцент, кандидат економічних наук Жебка Валентин Володимирович.
У вересні 2004 року кафедра обліку і фінансів розділилася на кафедру обліку і аудиту, яку очолила доцент, кандидат економічних наук Мержвинська Анна Миколаївна та кафедру фінансів і економічної кібернетики, на чолі з доцентом, кандидатом економічних наук Матвєєвим В’ячеславом Васильовичем.
У липні 2007 року кафедра фінансів і економічної кібернетики розділилася на кафедру економічної кібернетики із завідувачем професором, доктором економічних наук Олешко Тамарою Іванівною та кафедру, яка, об’єднавшись із кафедрою обліку і аудиту, утворили кафедру фінансів, обліку і аудиту із завідувачем професором, кандидатом економічних наук Матвєєвим В’ячеславом Васильовичем.
У червні 2015 року кафедру фінансів, обліку і аудиту очолила доцент, кандидат економічних наук Гайдаржийська Ольга Миколаївна.
Наказом ректора НАУ № 625/од від 20.12.2018 р. з 1 березня 2019 р. кафедру фінансів, обліку і аудиту перейменовано на кафедру обліку та аудиту.